Postdoctoral position in Leptin Gene Regulation and Adipocyte Biology

Mandrup-gruppen ved Syddansk Universitet inviterer ansøgninger fra fremragende kandidater til en postdoc-stilling. Stillingen er baseret ved Forskningsenheden for Funktionel Genomik & Metabolisme, Institut for Biokemi og Molekylær Biologi, Syddansk Universitet. Stillingen tilbydes for en varighed på op til tre år og vil være ledig fra den 1. januar 2027 eller snarest muligt derefter.

Projekt og Forskningsmiljø

Postdoc-stipendiaten vil arbejde på et projekt, der fokuserer på de molekylære mekanismer, der regulerer humant leptin (LEP)-genekspression i adipocytter. Målet er at identificere de cis-regulatoriske elementer, transskriptionsfaktorer og signalveje, der kontrollerer LEP-ekspression under adipocyt differentiering og i modne adipocytter. Desuden vil projektet belyse, hvordan kromatinarkitektur og fysiologiske signaler integreres for at regulere leptinproduktion. For at besvare disse spørgsmål kombinerer projektet komplementære og avancerede metoder, herunder:

• Kromatin konformationsanalyser (f.eks. Region-Capture Micro-C, Capture-C og relaterede metoder).
• Epigenomisk profilering (f.eks. ATAC-seq, CUT&Tag og DynaTag).
• Genomredigering og perturbationsmetoder (f.eks. CRISPRi, CRISPR/Cas9 og siRNA-medieret knockdown).
• Transkriptomiske og multi-omics analyser.
• Computational modellering af genregulatoriske netværk og integration med kliniske og fysiologiske data.

Projektet er indlejret i et tværfagligt forskningsmiljø, der kombinerer molekylærbiologi, funktionel genomik, beregningsbiologi og translationelle studier i primære humane adipocytter.

Jobbeskrivelse

Postdoc-stipendiaten vil drive eksperimentelle aktiviteter og bidrage til projektets videnskabelige udvikling. Stillingen kræver både selvstændigt arbejde og tæt samarbejde inden for forskningsgruppen.

Nøgleansvarsområder omfatter:

• Design og udførelse af eksperimenter, der undersøger reguleringen af human leptin (LEP)-genekspression.
• Generering og analyse af transkriptomiske, epigenomiske og kromatin konformationsdatasæt.
• Integration af multi-omics, fysiologiske og kliniske data for at identificere regulatoriske netværk, der styrer leptinekspression.
• Implementering og optimering af avancerede molekylære, genomiske og beregningsmæssige metoder i adipocytmodeller og primære humane adipocytter.

Derudover vil kandidaten:

• Bidrage til supervision og mentorering af studerende.
• Deltage i forberedelse af videnskabelige publikationer og formidling af resultater.
• Aktivt bidrage til et samarbejdsorienteret, ambitiøst og støttende forskningsmiljø.

Kvalifikationer

Syddansk Universitet søger en yderst motiveret kandidat med en stærk postdoc-forskningsprofil og ekspertise inden for funktionel genomik og molekylær regulering af genekspression.

Nødvendige kvalifikationer:

• En ph.d. i molekylærbiologi, genomik, biokemi eller et relateret felt.
• Stærk baggrund og eksperimentelle færdigheder inden for molekylærbiologi, funktionel genomik og transkriptionel regulering.
• Evne til selvstændigt at drive forskningsprojekter.
• Stærke samarbejds- og kommunikationsevner.
• Flydende i talt og skrevet engelsk.

Derudover er følgende kvalifikationer relevante, men ikke påkrævede:

• Praktisk erfaring med adipocytbiologi, metabolisk forskning eller cellulære differentieringssystemer.
• Erfaring med kromatin konformationsmetoder (f.eks. Capture-C, Micro-C, Hi-C eller relaterede metoder).
• Erfaring med epigenomiske og transkriptomiske teknikker (f.eks. ATAC-seq, CUT&Tag, RNA-seq eller relaterede sekventeringsbaserede assays).
• Erfaring med analyse og integration af multi-omics datasæt.
• Erfaring med beregningsbiologi, bioinformatiske pipelines og R til dataanalyse og visualisering.
• Praktisk erfaring med genomredigering og genperturbationsteknologier (f.eks. CRISPR/Cas9, CRISPRi eller RNA-interferens).

Syddansk Universitet tilbyder

• En stilling i et fokuseret, eksternt finansieret forskningsprojekt i frontlinjen af kromatinbiologiforskning.
• Adgang til state-of-the-art infrastruktur inden for genomik, billeddannelse og molekylærbiologi.
• Et internationalt, yderst samarbejdende og dynamisk forskningsmiljø.
• Stærk støtte til videnskabelig udvikling og karrierefremgang.
• Konkurrencedygtig løn og omfattende sociale ydelser.

Mandrup-gruppen

Mandrup-gruppen har en langvarig interesse i de detaljerede molekylære mekanismer, der styrer transskriptionel kontrol af adipocyt differentiering. Gruppen anvender en række sekvensbaserede, beregningsmæssige og molekylære teknologier, kombineret med tab- og gevinst-af-funktion strategier, for at studere mekanismerne og rollen af 3D kromatinarkitektur, krydstale mellem enhancers i enhancer-fællesskaber og rollen af specifikke transskriptionsfaktorer.

Den ansatte vil arbejde tæt sammen med andre postdocs og ph.d.-studerende i gruppen. Der forventes også et samarbejde med kolleger i Center of Excellence in Functional Genomics and Tissue Plasticity (ATLAS) og Center of Adipocyte Signaling (ADIPOSIGN), som begge ledes af Susanne Mandrup. Desuden vil den ansatte kunne drage fordel af gruppens mange internationale samarbejder.

Forskningsenheden for Funktionel Genomik & Metabolisme

Mandrup-gruppen er beliggende i Forskningsenheden for Funktionel Genomik & Metabolisme ved Institut for Biokemi og Molekylær Biologi, Syddansk Universitet. Forskningsenheden huser i øjeblikket otte uafhængige forskningsgrupper, der fokuserer på, hvordan specifikke celletyper regulerer genekspression, og hvordan dette påvirker udviklingen og funktionen af celler og væv. Forskningsenhedens arbejde sigter mod bedre at forstå, hvordan gener regulerer menneskelig fysiologi og sygdomme som fedme, fedtlever, kræft og diabetes.

Forskningsenheden udgør et internationalt, ambitiøst, yderst dynamisk og veludstyret arbejdsmiljø. Enheden og instituttet har state-of-the-art faciliteter til næstegenerationssekventering, single-cell transkriptomik og epigenomik, flowcytometri, massespektrometri, metabolomik, bioimaging, cellekultur samt diætintervention og transgene musemodeller. Enheden opretholder strategiske forskningsalliancer med Odense Universitetshospital (OUH). Dette giver et yderst stimulerende forskningsmiljø med talrige muligheder for læring og udvikling af nye idéer.

Ansøgningsfrist: Den 1. december 2026 kl. 23:59, lokal dansk tid.

Fuldstændigt opslag og ansøgningsvejledning kan findes på Syddansk Universitets hjemmeside.